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一个色综合 AI发现超16万种RNA病毒,中山大学、阿里云聚首霸术效果在外洋顶刊《Cell》发表

发布日期:2024-10-13 17:04    点击次数:59

一个色综合 AI发现超16万种RNA病毒,中山大学、阿里云聚首霸术效果在外洋顶刊《Cell》发表

10 月 10 日音问一个色综合,外洋顶级学术期刊《Cell》发表了中山大学与阿里云协作的科研效果,霸术团队应用云规划与 AI 时间发现了 180 个轶群、16 万余种全新 RNA 病毒,是已知病毒种类的近 30 倍,大幅擢升了业界对 RNA 病毒千般性和病毒演化历史的领会。 

 

《Cell》是外洋公认学术声誉最高的期刊,代表人命科学领域的最高水平。国内每年入选《Cell》的论文数目仅罕有十篇。这次入选的论文冷漠了一种基于深度学习的 RNA 病毒发现门径,是深度学习算法在病毒发现领域的里程碑式进展,为病毒学霸术创举了全新范式。

病毒与东谈主类的健康密切关系,但东谈主类已知已说明的病毒种类仅有 5000 余种,这仅仅病毒寰球的冰山一角。传统 RNA 病毒武断门径高度依赖于序列同源性比对,即通过比拟未知病毒与已知病毒的序列相通性来进行识别。然则,RNA 病毒种类众多且高度分化,传统门径难以捕捉缺少同源性或同源性极低的"暗物资病毒",新病毒发现的效用较低。

AI 与病毒学霸术的衔尾正在梗阻这一坚苦。本篇论文冷漠了全新的深度学习模子 "LucaProt",它基于 Transformer 框架与大模子表征时间,衔尾卵白质序列和内在结构性特征,在独处的测试数据集上发扬优异,具有极高的准确性(假阳性率仅为 0.014%)和特异性(假阴性率为 1.72%)。

 

据先容,霸术团队对来自环球生物环境样本的 10,487 份数据进行病毒挖掘,发现了 513,134 条病毒基因组,代表 161,979 个潜在病毒种及 180 个 RNA 病毒轶群。使 RNA 病毒轶群数目扩容约 9 倍,病毒种类增多约 30 倍,其中 23 个轶群无法通过序列同源门径识别,被称为病毒圈的"暗物资"。

该论文还揭示了多个病毒学领域新发现:发现迄今纪律最长的 RNA 病毒基因组,长度达到 47,250 个核苷酸;识别出超出以往领会的基因组结构,展示了 RNA 病毒基因组进化的无邪性;此外,在高温的深海热泉等极点环境中,RNA 病毒依旧存在千般性。

中山大学医学院讲解施莽默示:"在科研领域,AI 的应用照旧势不行挡,通过 AI 门径探索科常识题已获取了迫切梗阻。这种霸术范式将成为将来科学界的常态,也可能成为咱们领会寰球的迫切技巧。"

该论文共同第一作家、阿里云飞天执行室算法众人贺勇默示:"基于 AI+ 病毒学的新霸术框架刷新了东谈主类对病毒圈的意志,跟着这种意志的不断完善,有助于东谈主类对将来可能发生的大流行进行预警,以及进一步鼓吹 RNA 病毒疫苗的研发。"

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据悉,曩昔几年,阿里云积极与国内高校和霸术机构伸开协作,在人命科学领域已发表核酸和卵白质融合基础模子 -LucaOne、RNA 病毒发现 -LucaProt、磷轮回卵白家眷识别 -LucaPCycle 等霸术效果。

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